こちらも纏めてみました。

とりあえず比較的意見が多かったもの（3人以上）から。上に行くほど挙げた人数が多い意見となっています。

• オンライン対戦。
• キャラクター関係。瞳の色とかいろんな場所の色変更。服の変更。アイテムの種類の増加。
• シナリオ（ストーリー）モード。
• キャラクターの追加。
• ネット・携帯との連携機能。
• 称号戦のシステムの改善。
• オリジナルキャラ作成機能。
• エスパトシナ・ノザリアード・サザンロックの復活。
• 2on2のシステム。

とにかくオンライン対戦は希望者が多く、何と過半数を超える方が希望していました。

以下は少数意見。

• カード排出なしでのプレイが可能となる設定（その代わり安く）。
• 変身、合体、変形などのモンスター。
• 視点変更等の視野視点に関する操作。
• ケルピーをもういちど移動値４にしてほしい。
• 乱入が来たら、最初から仕切り直し。
• 最初のデッキ読み込み時だけでなく、プレイ中のカード情報表示の時にそのカードの熟練度も表示して欲しい。
• 一人用の撤廃。
• ゲーム料金（IC・スターター）を安く。
• 全国ランキング。
• 上位学年にも課題モードを。
• 自分でシャッフルボタン。
• 1回200円を公式のものとする。
• 途中で名前の変更を可能に。
• キャラクターのカスタマイズをクリアアイテム風に。
• 魔導競技会にランダムで選ばれたカード50枚から即興でデッキを組む等のシールド戦要素。
• サテライト上でのブースタードラフト機能。
• 賢者の城130回到達のアイテムが貰えないバグを直してほしい。
• 協力プレイモード（お邪魔CPU等を皆で撃退するとか）。
• 弐で以前よりもかなり弱くなったカードを強くして欲しい。
• これ以上カードの種類が増えるといらないカードが出すぎるので何とかしてほしい。
• お金を入れなくてもカード経験値を見られれば便利。
• ダグダやディアドラから上位称号を奪えるようにして欲しい。
• これ以上ケルピーを弱くしないでください。
• アクションをつけて欲しい。
• 時計機能。
• 手札覗き防止機能。
• 他のセガ（ないしは他社）ゲームとのコラボレーション。
• デッキ枚数を増やして欲しい。
• とにかく魔神とルカを何とかして欲しい。
• 三国志大戦のようにカードの使用率。
• CPUでライバルキャラみたいなのが乱入してくると良い。
• 現状で使いにくいカードの上方修正エラッタ（弱くするのではなく強くする方向での修正）。
• WCCFの新バージョンのようにCPUのデッキが特定のプレイヤーのものになったり。
• タッチパネルを生かしたミニアクションゲーム。
• CPUを強く。
• インパクトは薄くなりますがメイン画面無し筐体とか更に単サテ動作可能な物が発売すれば、置き場所の無いお店は勿論、個人で購入する人も(ぉ。
• キャラごとの限定カード。
• EXシリーズの復刻。
• オンラインが出たら奇跡の勝利とか悪夢の一戦のリプレイ画面が見たい。
• 戦闘支援カードに映像効果を入れてほしい。
• ターン終了時のライフコストを1に。
• 画面に出るポインタや妖精を選択できる機能。
• 通常マップでモンスターをタッチした時にカード情報を見れるようにしてほしい（現在は全体マップのみ）。
• 4人対戦中でもCPUが乱入する。
• 使い魔の育成。
• 体験プレイでのカード排出。
• プレイ料金設定の変更。
• 唱えたときに手札にあるモンスター全てに避け無効能力など（避け・確立即死・即死無効・その他）がつく魔法またはスキルカード（？）。
• キャラ別にカードの効果が少し変わると良い。
• マップ上魔法でSRのカード。
• 反射や反射無効系のカードを増やす。
• 店内対戦をもっと盛り上げるシステムがほしい。
• 全国・店内のプレイヤーと協力プレイがしたい。
• 無属性４マス移動カードのＳＲ。
• 1人プレイと対戦プレイの獲得証数の差を広げる。
• 先制・避け・即死・反射・反撃および無効系以外の新しい能力（吸収とか連撃とか）。
• 召喚技術のランクをプレイ中に反映。選択した紋章を付けるだけでもいいので。
• 1プレイに１回だけの必殺技（？）を盛り込む。
• カードにホログラム処理とか、箔押しとかして欲しい。
• 対戦＝段位認定の図式を取り外せるようにして欲しい。
• 種族Lvではなくよく使うモンスターの通り名が付くようにする。
• 三国志大戦みたいにカードコストがあれば良い。
• みんなが進んで対戦できる環境づくり。もちろん初心者にもやさしい。
• 手の油のつきにくいタッチパネル。
• 手札６枚の組み合わせによるターン開始時ボーナスのルール。
• 戦闘時能力の増加。
• モンスターの種族の増加。
• 複数モンスターによる団体戦。
• ICカードにももっと愛着がわくよう、魔導Ｌｖ以外にも育成要素を。（やり込めば対戦で有利になるものではない）。
• 称号以外のランキングもいくつか用意してほしい（平均魔道レベルや勝敗数など）。
• マップ選択機能。
• ＣＰＵと自分のキャラがかぶらないようにしてほしい。
• 「魔法反射」をもっと使いやすくしてほしい。
• キャラや一定のカードの組み合わせでの特別演出。
• 1on1のシステム。
• 壱・弐のカードは排出しない（カードデータの変更なしで）。
• 全国大会の実施。
• ＮＰＭ（ノンプレイヤーモンスター）の徘徊。
• マップ上のトラップ。
• ローザでもっと露出度の高い服を。
• ＣＰＵもアヴァロンぐらいの強さで登場してほしい。
• １プレイ３００円でよいので排出を1パック複数カードにして欲しい。
• 話が大きくなってきたのでローザとかカルノとか特定キャラでなくアカデミーの一生徒としてのキャラクタでプレイしたい。
• デッキ２９枚以下のときの補充カードでしか見られないカードを作ってほしい。
• 色変えの際にデフォルトの色に戻すキーが欲しい。
• コンピュータ戦でも、昇級戦が楽しめるようにして欲しい。
• 強制ゲームオーバー機能。
• 魔道レベルの限界が出るたびに伸びていくのはやめて欲しい。
• 種族デッキの特色、バリエーションを増やして欲しい。
• ごくたまにマップ上アイテムとしてクレジット。
• ポリゴンの美化。
• 使いレベル上げて欲しい（10ぐらい）。
• 通常の対戦でもレア制限が設けられる。
• デッキの制限にハイランダー（同じカードを2枚以上入れない）の導入。
• カード読み取り機能の強化。
• 称号、ランキングなんかは要らない。
• ネット対戦はいらない。
• 魔導競技会を活性化させてほしい。
• 一部、脱げる仕様にしてくだｓ（ﾅﾆｦｽﾙｷｻﾏﾗｰ

どうですか？ 見てみるとああこういうのが実現したらいいなぁと思うものがありますよね？

最後にちょっと長文を送ってきた方がいたので紹介します。

• いろいろと考えている事があるので、長文になる事を最初に書いておきます。まず最初に欲しい機能といえば、一番要望が多いでしょうネットワーク対戦対応です。一人で何枚も使った自作自演に対しての対策をして欲しいです。同じ店からネット対戦に繋げると、同じ対戦グループには入らないようにするなど。
• 称号認定戦について、現在だと同じポイントが行ったり来たりすることが多いので、わずかながら解消するために、称号認定戦が始まった際に、１/１２８や１/２５６ぐらいの確率で取得ポイントが２倍になるボーナスモードがつくなどの、機能を取り入れて欲しいです。相手が奪われるポイントなどを現在のままにすれば、ポイントの総量がわずかに上がると思いますし。
• 最後にカードの新能力について。他のゲームのバイバックなどと同じように、カードを使った後特定の条件を満たせば手札に戻ってくる機能が一部のカードに欲しいです（戻ってきたと使用すれば破壊に）。
• ハンドコストやタイムコストと併用すれば、一部のカードの使い勝手を上げられます。例えば消滅は、コストなしで戻ってくるようにすれば、遠距離戦などを２回までノーダーメージで切りぬけられるカードになるし、聖女の加護や勇者の精神などをハンドコストで発動するようにすれば、使い勝手は良くないものの、連続防衛の可能性があるカードになりますし、時の隼や女神の息吹などをタイムコストで戻ってくるようにすれば、戻ってきたカードをさらに天女の羽衣などのコストにすることで、魔法カードの重さを解消することができます。
• 以上好き勝手に書いてしまいました。